Het is weken geleden sinds Dexter Morgan, een seriemoordenaar die seriemoordenaars doodt, neergeschoten is door zijn eigen zoon, Harrison. Nadat hij uit zijn coma ontwaakt, is Harrison nergens te bekennen. Dexter vertrekt naar New York City om hem te vinden en alles goed te maken. Als hij ontdekt dat oud-collega Angel Batista ook in de stad is, realiseert Dexter zich dat zijn verleden hem snel inhaalt. Terwijl vader en zoon hun eigen duisternis doorkruisen, komen ze er stapsgewijs achter dat ze enkel samen een uitweg kunnen vinden.
